污水處理菌種按其功用首要分為以下幾類：

1. 硝化細菌：是一種好氧性細菌，包含亞硝酸菌和硝酸菌。

日子在有氧的水中或砂層中，在氮循環水質凈化過程中扮演著很重要的角色。廣泛存在大自然各個角落，空氣、江河、大海、土壤都有，生物學中發現的硝化細菌有幾千種之多。

2. 反硝化細菌：反硝化細菌是一種能引起反硝化效果的細菌。

多為異養、兼性厭氧細菌，如反硝化桿菌、斯氏桿菌、螢氣極毛桿菌等。它們在氙氣條件下，運用硝酸中的氧，氧化有機物質而獲得本身生命活動所需的能量。反硝化細菌廣泛散布于土壤、和污水中。能夠將硝態氮轉化為氮氣而不是氨氮。首要應用于污水處理,如景觀水管理,城市河道管理,水產養殖處理等。

3. 硝化反硝化復合菌種：具備硝化和反硝化雙重效果的復合菌種，在污水處理環境日益復雜的情況下，單一運用硝化或反硝化菌種越來越難到達菌種平衡。

4. COD降解菌種：COD降解菌首要應用于污水生化池降解COD指標運用。

首要降解廢水中的COD，改進水質色度、增大污泥絮體顆粒、調整污泥絮體結構，按捺藻類成長繁。污水生化池有機物濃度過高或許生化池容積較小時，高負荷污水流入簡單對生化池中的微生物形成沖擊。對于通過預處理后污水的高濃度COD指標，在生化池培育菌種過程中，可適當投加一些COD降解菌種，能有用的去除COD，并能更好的穩定生化體系。